Это на самом деле не сложно:
function moveDiv(t,mdiv) {
t = t + 0.05; // "time"
var r = 10, //radius of circle
xcenter = 400, //x location of circles centre on screen
ycenter = 400, //y location of circles centre on screen
x = Math.floor(xcenter + (r * Math.cos(t))), //circles parametric function
y = Math.floor(ycenter + (r * Math.sin(t))); //circles parametric function
mDiv.style.top = x + "px"; //set divs new coordinates
mDiv.style.left = y + "px"; //set divs new coordinates
setTimeout(function() { //make sure the animation keeps going
moveDiv(t,mdiv);
}, 100);
}
myDiv = //get div element
moveDiv(1,myDiv); //start the animation
Не проверял, но это о том, как это должно работать. Убедитесь, что вы установили свойство css "position" этих div на абсолютное или фиксированное. Также взгляните на параметрическое уравнение для круга.