Ход:
[[window layer] addAnimation:transition forKey:nil];
ниже:
[window makeKeyAndVisible];
Вы явно создаете анимацию, но применяете анимацию «До», вы хотите добавить подпредставление в окно. Разместив его ниже, вы сообщаете Окну, что хотите анимировать расположение подпредставления.