Я думаю, что это известная проблема, потому что я ее тоже видел - в основном в IE9. Если, например, у вас слишком длинный заголовок внутри более узкого столбца, он выравнивает содержимое столбца в строке заголовка из-за выравнивания, и часть слова будет перекрывать следующий столбец, как будто «переполнение» на класс игнорируется.
В качестве быстрого исправления, если вы установите ширину столбца шире, чем текст в заголовке, это не покажет проблему выравнивания. Я знаю, что это не лучший вариант решения проблемы, потому что если кто-то вручную свернет ширину в этом столбце, он снова испортит выравнивание.
Лучше всего я могу сказать, когда я смотрю на CSS для jqGrid, <div>, который содержит текст внутри <th> для этой строки, имеет проблему совместимости переполнения со стилями, примененными к самому <th>, который контролирует пробел, float и выравнивание текста.