Попробуй это.Я специально разбил различные части, чтобы вы могли перемещать вещи.
library(sfsmisc)
#Generate the data
x <- 1:100000
y <- 1:100000
#Setup the plot area
par(pty="m", plt=c(0.1, 1, 0.1, 1), omd=c(0.1,0.9,0.1,0.9))
#Plot a blank graph without completing the x or y axis
plot(x, y, type = "n", xaxt = "n", yaxt="n", xlab="", ylab="", log = "x", col="blue")
mtext(side=3, text="Test Plot", line=1.2, cex=1.5)
#Complete the x axis
eaxis(1, padj=-0.5, cex.axis=0.8)
mtext(side=1, text="x", line=2.5)
#Complete the y axis and add the grid
aty <- seq(par("yaxp")[1], par("yaxp")[2], (par("yaxp")[2] - par("yaxp")[1])/par("yaxp")[3])
axis(2, at=aty, labels=format(aty, scientific=FALSE), hadj=0.9, cex.axis=0.8, las=2)
mtext(side=2, text="y", line=4.5)
grid()
#Add the line last so it will be on top of the grid
lines(x, y, col="blue")