Обычно это папка, в которой находится ваш сервер приложений. если я правильно помню, у glassfish обычно есть две вложенные папки «glassfish» - там это будет в первой.
Лучший способ исследовать это самостоятельно (и быть уверенным) - это поместить свои portal-ext.properties в любое место, которое, как вы предполагаете, может быть, затем запустить сервер и изучить журнал. Там упоминается, какой файл читается.
Кроме того, AFAIK portal-ext.properties также будет считываться из домашнего каталога пользователя, если он там найден - осторожно, когда вы запускаете сервер, такой как glassfish, это может быть учетная запись пользователя, отличная от вашей.