Они определенно являются ресурсами пакета установки. Это означает, что они не устанавливаются в папку вашего приложения, но установщик Windows должен извлекать его изнутри во временное местоположение, чтобы использовать его функциональность. И он должен убирать за собой. Но это определенно не видно конечным пользователям вашей установки.
По крайней мере, я так понимаю.