Когда вы создаете свой объект конфигурации, просто назовите его по-другому
<?php
require_once '/path/to/htmlpurifier/library/HTMLPurifier.auto.php';
$htmlpur_config = HTMLPurifier_Config::createDefault();
$htmlpur_config->set('Core.Encoding', 'ISO-8859-1'); // replace with your encoding
$htmlpur_config->set('HTML.Doctype', 'HTML 4.01 Transitional'); // replace with your doctype
$purifier = new HTMLPurifier($htmlpur_config);
$clean_html = $purifier->purify($dirty_html);
?>
Ключ создает объект $config
и передает его в конструктор для HTMLPurifier