Краткий ответ: нет.
Немного более длинный ответ: с сервером веб-приложений с открытым исходным кодом, таким как Tomcat, вы можете запустить его в Eclipse. Вы можете устанавливать точки останова, проверять значения переменных во время выполнения и т. Д. Тем не менее, Microsoft настолько далека от того, что вы можете получить; если вы хотите запустить IIS через отладчик, вам придется использовать Visual Studio или какой-либо аналогичный инструмент только для MS, потому что именно так MS разрабатывает вещи.
Конечно, как отметил Кекоа, вы всегда можете загрузить отдельные файлы в Eclipse, но тогда вы просто используете его как прославленный текстовый редактор; чтобы использовать все возможности "IDE", вам действительно нужно использовать стек не-MS (и вообще не принадлежащий компании).