Что такое вход в Windows?Вход в систему возможен только для пользователя. Если вам нужно, чтобы приложение хоста службы запускалось после загрузки компьютера, вам нужно разместить его в Windows Service .Если вам нужен какой-то процесс для запуска после входа пользователя, вы можете создать простое консольное приложение и добавить его в Startup (приложения, работающие после входа пользователя).
В любом случае создание службы WCF для копирования файлов - это глобальная ерунда,Похоже, что всем известно, что WCF - это технология для передачи больших объемов данных.Это не так - особенно это не технология для передачи файлов.Используйте общие диски и обычное копирование файлов - пользовательский пакетный файл можно добавить на каждом компьютере в Startup или установить FTP (часть IIS, доступная в Windows 7 Ultimate).