Я пишу скрипт, который использует roxygen2 для автоматической оксигенации моего пакета. Мне бы хотелось, чтобы он был исполняемым, чтобы он мог быть частью более крупного сценария для подготовки и установки пакета, но я по какой-то причине не могу заставить его работать с Rscript.
Вот код:
#!/usr/bin/env Rscript
library(roxygen2)
roxygenize('.', copy=FALSE)
Это работает правильно, если я начинаю интерактивный R-сеанс или если я отправляю код, используя R CMD BATCH. Однако, я получаю эти выходные данные и ошибку, если я запускаю сценарий напрямую как исполняемый файл через Rscript (и я получаю сообщение об ошибке независимо от того, находится ли сценарий в текущем каталоге или в папке bin).
bin/roxygenize.R
Loading required package: digest
Warning message:
package 'roxygen2' was built under R version 2.13.2
Error in parse.files(r_files) : could not find function "setPackageName"
Calls: roxygenize -> parse.files
Execution halted
Похоже, setPackageName находится в базе R, поэтому я не могу понять, почему его там нет. Кроме того, я использую Rscript во многих других ситуациях, и это, кажется, единственное место, где он терпит неудачу.
Любая помощь очень ценится.