Вы ссылаетесь на настройки регистрации ошибок php? Или какая-то настраиваемая конфигурация регистрации ошибок, специфичная для вашей работы cron?
В любом случае, у вас есть несколько вариантов.
Вариант 1. Отредактируйте команду php в задании cron, включив в нее аргументы, которые вы хотите передать скрипту, и получите их с помощью $ argv & $ argc. См http://us2.php.net/manual/en/features.commandline.php#86616
Вариант 2. Если вы изменяете опции регистрации ошибок php - только для скриптов, запускаемых из cli, вы можете внести эти изменения в ваш php-cli.ini (или как он там может быть назван в вашей системе)
Вариант 3. Если вы не хотите изменять файл php-cli.ini, вы можете скопировать файл php-cli.ini в другое место, внести необходимые изменения, а затем изменить команду php в задании cron, чтобы использовать -c /path/to/new/php-cli.ini.
Вариант 4. Установите переменные окружения на вашем сервере и получите с помощью $ _SERVER ['ENV_VAR_NAME_HERE']
У меня возникнет соблазн перейти к варианту 1, если только несколько сценариев не используют одинаковые аргументы.
Удачи.