Вы пробовали загружать напрямую через XCode? Если у вас проблемы с загрузчиком приложений, стоит попробовать альтернативный маршрут. Создав и заархивировав свой проект, перейдите в XCode Organizer, выберите архив выбранного приложения и нажмите кнопку «Отправить». Таким образом, вы можете быть уверены, что у вас будет правильный двоичный файл.
Я перестал использовать загрузчик приложений некоторое время назад, как только XCode получил возможность отправлять прямо в магазин приложений.