Это невозможно, поскольку WebStorm сохраняет все файлы автоматически при необходимости , при сохранении отдельного файла нет триггера для вызова.
В качестве обходного пути вы можете создать макрос, который сохранит все файлы и запустить внешний инструмент, а затем привязать этот макрос к стандартному ярлыку «Сохранить все». Теперь, когда вы сохраняете файлы с помощью горячей клавиши, IDE также запускает ваш пакетный скрипт.
Другим возможным решением будет использование некоторого внешнего сервиса, который будет следить за указанными файлами на предмет изменений и запускать внешний инструмент при их изменении.