Хотя было бы установить атрибуты left и top так, как если бы не было позиции: absolute-parent и add, скажем, класс "body_pos":
$(function() {
$('.body_pos').each(function() {
var offset = $(this).offset();
$(this).css({
left : '-='+offset.left,
top : '-='+offset.top
});
});
});
Пример: Вы установили left:50px, элемент позиционируется слева: 100px в документе, затем он будет позиционироваться слева: -50px.
Он должен давать желаемый эффект, если он не расположен внутри поля: 0 auto box, ия полагаю, размер окна изменен.