Поскольку вы импортируете функцию glob () непосредственно в локальное пространство имен, вы должны получить дескриптор текущего модуля.
from flexmock import flexmock
from glob import glob
import sys
flexmock(sys.modules[__name__]).should_receive('glob')
Вы также можете выполнить «импорт glob as glob_module» иличто-то в этом роде, чтобы избежать поиска sys.modules.