Два достойных варианта:
Вариант 1. Напишите программу на C #, которая будет использовать библиотеки DAO для автоматизации Access и выполнения операторов программно.
dao.DBEngineClass dbengine = new dao.DBEngineClass();
dbengine.OpenDatabase(path, null, null, null);
dao.Database database = dbengine.Workspaces[0].Databases[0];
database.Execute(sql, null);
Вариант 2: Написать модуль VBA в базе данных, который будет делать то же самое, используя метод CurrentProject.Connection.Execute()
.
В любом случае вы можете поместить этот код в цикл, который читает ваши операторы и выполняет их один за другим.