В SQL легко сравнивать две таблицы и вставлять строки не в одну таблицу. Например:
INSERT INTO TableA
(col1, col2, col3)
SELECT
col1, col2, col3
FROM SpreadSheetTable
WHERE NOT EXISTS (
SELECT *
FROM TableA
WHERE TableA.col1 = SpreadSheetTable.col1
)
Этот запрос вставляет все строки из SpreadSheetTable в TableA, кроме тех строк, для которых TableA уже содержит строку с таким же значением "col1".