Ваш проект развертывания должен быть в том же решении, что и ваше приложение, и тогда он может быть нацелен на «Первичный вывод» проекта вашего приложения, а не вручную выбирать файл .exe: каждый раз, когда проект создается, он затем используетвыходные данные проекта, поэтому вам не нужно ничего делать для обновления, кроме как для изменения версии проекта развертывания и построения решения в конфигурации, настроенной для построения проекта развертывания.