Как сказал v01d, нет никакого способа явно указать scrapy использовать scrapy.cfg, где бы он ни находился, в дереве каталогов, но если вы посмотрите на реализацию closest_scrapy_cfg - https://github.com/scrapy/scrapy/blob/master/scrapy/utils/conf.py#L24 - вы можете переместить scrapy.cfg поднять любой уровень до корня, и он его найдет.
Так, например, если ваш scrapy.cfg по умолчанию:
/ home / whats / scrapy-projects / abc / scrapy.cfg
вы можете переместить его на один или несколько уровней.
Не уверен, в чем же преимущество.