Оказывается, мне нужно было добавить enqueue_script ПЕРЕД вызовом wp_head, а также использовать другой URL-адрес thingamabob.Вот окончательный код:
function add_my_scripts(){
wp_register_script('jqtransform',
get_bloginfo('stylesheet_directory').'/includes/jqtransform/jquery.jqtransform.js', array('jquery'),'1.0');
wp_enqueue_script('jqtransform');
}
add_action('init', 'add_my_scripts');