Чтобы развить ответ Малако, у меня ситуация симлара. Моя проблема заключалась в том, что мои строки подключения находятся во внешнем файле
<connectionStrings configSource="some_other_file.config">
В мастере «Обновление моделей» есть ошибка, из-за которой он не будет искать во внешнем файле строки подключения, и я не могу оставить строку подключения в теге connectionStrings, поскольку она должна быть пустой, иначе при сборке возникнет ошибка.
Обходной путь для меня - использовать мастер обновления, установите флажок «Сохранить строку подключения сущности в Web.config», а затем добавьте все мои импортные функции. Когда я закончу, я закомментирую connectionString, чтобы мой проект был построен. В следующий раз раскомментируйте эту строку подключения объекта перед обновлением моделей.
Раздражает, но, по крайней мере, есть способ заставить его работать.