Для чтения из файлов PDF вам потребуется установить пакет XPDF.
Когда у вас установлен XPDF / pdftotext, вы запускаете следующую инструкцию PHP, чтобы получить текст PDF:
$content = shell_exec('/usr/local/bin/pdftotext '.$filename.' -');
Вы можете скачать XPDF с http://foolabs.com/xpdf/