Ответ, как представляется, заключается в том, что это зависит от используемого модуля.
pam_exec.so
записывает ряд переменных (согласно странице руководства) в среду сценария оболочки, исключая пароль. Если требуется пароль, вам следует включить аргумент expose_authtok, и он будет записан в STDIN, за которым следует маркер.