Я не уверен, полностью ли я понял вопрос. Вот что может вам помочь:
Если вы хотите, чтобы приложение с графическим интерфейсом начиналось с окна консоли, добавьте следующую информацию в командную строку линковки (ansi):
/ запись: "WinMainCRTStartup" / подсистема: консоль
или (Unicode)
/ запись: "wWinMainCRTStartup" / подсистема: консоль