Попробуйте использовать GDB, чтобы увидеть, где это происходит.Вы используете последнюю версию CUDA, 4.2?Я обнаружил, что некоторые из моих кодов CUDA будут иметь ошибки разрушения стека при обновлении с CUDA 4.0.Возвращение к CUDA 4.0 исправило мои проблемы.