Не должно быть проблемой, чтобы два были получены одновременно. Почтовый транспортный агент (MTA = postfix, sendmail, exim и т. Д.) Поставит их в очередь для доставки в ваш скрипт. С точки зрения вашего сценария, даже если несколько его копий выполняются как параллельные процессы, каждый отдельный процесс получит свой собственный входной поток STDIN. Они не будут мешать друг другу.
Это на самом деле ничем не отличается от MTA вашего сервера, получающей почту и передающей ее через некоторый уровень обработки, такой как Spamassassin или Procmail.