Ваш вопрос неясен, поскольку существует множество переменных, которые могут вас заинтересовать или не заинтересовать.
Одна из возможностей - установить совершенно новую систему Windows или Linux (если какая-либо из этих ОС актуальна,или, по крайней мере, не наносят ущерба вашей цели), установите только JRE и тестовое программное обеспечение, отключитесь от Интернета и запустите свои тесты.
Если вы хотите использовать JVM в других системах, или выЕсли официальная JRE слишком громоздка и повлияет на ваши результаты, вам очень хочется попробовать http://oss.readytalk.com/avian/ - JVM, которую относительно легко перенести на несколько произвольных систем.Конечно, есть и другие подобные портативные альтернативы.