Очевидно, что вы не можете запустить просто запустить обычный T-SQL в базе данных mysql. Каждая база данных имеет свой собственный вкус SQL. Однако вы могли бы выбрать платформу, поддерживающую обе базы данных, и перенести данные, сначала загрузив их в программу.
Однако mysql и SQL Server - это очень разные базы данных, и они поддерживают совсем другой набор функций. Во-первых, вы должны убедиться, что вы действительно можете мигрировать, потому что между двумя базами данных неизбежно возникнут проблемы, о которых вы даже не задумывались.