Теперь есть способ сделать это с помощью самого imageMagick (без команд оболочки), который имеет преимущество в том, что он не зависит от платформы.
Согласно документации imagemagick вы можете сделать
mogrify -format gif -path thumbs -thumbnail 100x100 *.jpg
для создания миниатюр для всех ваших JPG в thumbs/
Просто убедитесь, что каталог существует.