Проблема, с которой вы, скорее всего, сталкиваетесь, заключается в том, что вы не изменили конфигурацию запуска в eclipse. Пока имя пакета не изменено, нет необходимости редактировать файл .gwt.xml, кроме как переименовывать его. Изменение имен модулей переименования и точки входа не требуется, поскольку необязательно, чтобы они совпадали с именем модуля. Строка rename-to изменяет имя создаваемой папки и javascript-файлов, поэтому, если вы ее измените, не забудьте поменять тег script в html-файле.