Нет, невозможно передать exe через командную строку, самое близкое, к чему вы могли бы прийти - это передать его по конвейеру, но вам нужно будет сделать set-mode на stdin to binary. Но лучшим решением было бы передать путь к исполняемому файлу в загрузчик эмуляции, загрузить его и передать данные по буферу / указателю / ссылке на эмулятор.