Если под пользовательским маршрутом вы подразумеваете «именованные маршруты», то T4MVC действительно ничего для них не генерирует, так как для этого потребуется анализ вашего кода.
Вместо этого, простая вещь - это просто определитьобщедоступная константа с именем маршрута, и используйте ее как в определении маршрута, так и там, где вам нужно обратиться к названному маршруту.