Ну, во-первых, вы никогда не должны устанавливать бета-версию на устройство, которое не предназначено для тестирования, поскольку оно будет безумно глючным.
Кроме того, с вами все будет в порядке, если вы ...
1) Установите iOS 5 SDK в отдельном каталоге, поскольку бета-версия SDK не может отправлять приложения в App Store.
2) Не используйте в своем приложении какие-либо API-интерфейсы для iOS 5, поскольку это вызовет проблемы в любой другой версии ОС.