Вы должны быть в состоянии сделать это с помощью iText или iTextsharp. Однако у iTextsharp есть 0 документов, и большое количество функций не эквивалентно тем, которые есть в iText.
PDFSharp не поддерживает потоки iref. Это практически единственные комплексные решения с открытым исходным кодом. Если вы не возражаете платить, решения Vista могут иметь что-то для вас, они в основном обрабатывают рабочий процесс, но у них также есть довольно обширные библиотеки PDF.