Javascript (и jQuery) работают с узлами DOM (элементы как объекты), а не с текстом.
Вы можете получить этот код в виде текста HTML и заменить обычную строку следующим образом:
var f = $('#flashObj');
f.html( f.html().replace('append_HERE', 'append_HERE_the_new_stuff') );
Или, что еще лучше, вам следует избегать игры с HTML в качестве текста и вместо этого изменять сам атрибут:
var f = $('#flashObj param:first');
f.attr('value', f.attr('value').replace('append_HERE', 'append_HERE_the_new_stuff') );
var f = $('#flashObj embed');
f.attr('src', f.attr('src').replace('append_HERE', 'append_HERE_the_new_stuff') );
PS : Вы, вероятно, захотите выполнить глобальную замену с использованием регулярного выражения, поскольку "bar bar".replace("bar", "foo")
возвращает 'foo bar'
.