Конфигурация Joomla позволяет установить пользовательский уровень сообщения об ошибках, который переопределяет тот, который установлен в php.ini
Вы пробовали?
error_reporting = E_ALL & ~E_NOTICE & ~E_STRICT & ~E_DEPRECATED
Я думаю, это будет работать.Удачи.