Вы можете иметь только одно рабочее пространство для всей среды, так как оно будет управлять различными перспективами, связанными с каждым языком.
При этом, поскольку Eclipse ввел функцию «переключения рабочего пространства», вы можете определить несколько рабочих областей, но это закроет / перезапустит Eclipse.
Если вы работаете в тесном контакте с источниками, включая все три языка, одно рабочее пространство - ваш лучший выбор.