jstree имеет довольно обширный обработчик mousemove
, $.vakata.dnd.drag
, который может быть виновником. В коде могут быть и другие обработчики перемещения мыши.
Скорее всего, это связано с низкой производительностью JS в IE и большим количеством операций в обработчике перемещения мыши, который срабатывает много раз в секунду при перемещении мыши.