Другое возможное решение заключается в том, что у Passenger-процесса нет прав на запись в ваш лог-каталог.Если он не может открыть эти файлы для записи, вы начнете видеть лог-сообщения в /var/log/apache2/error.log
По крайней мере, так было в нашем случае.