Вы должны сохранить все клики в БД. База данных создается для обработки данных, которые вы пытаетесь сохранить.
Кроме того, база данных позволит вам анализировать ваши данные намного проще, чем простой файл. Если вы хотите построить график трафика из страны, или по пользовательскому агенту, или по диапазону дат, это будет почти тривиально в базе данных, но анализ файлов журнала giganitc может быть более сложным.
Также базу данных будет легче расширять. Прямо сейчас вы просто отслеживаете клики, но что произойдет, если вы захотите начать публиковать рекламные объявления, требующие каких-то дополнительных действий пользователя или конверсии. Вы сможете расширить это за пределы кликов очень легко в базе данных.