Мой .apk содержит файл .so вместе с файлом .dex.Как я могу предотвратить кражу моего .so файла?
Это невозможно. Все файлы внутри apk-файла могут быть легко декомпилированы / распакованы. Либо вы шифруете свой локальный файл apk, либо сохраняете их на сервере и загружаете их во время выполнения. Но 100% защиты никогда не будет.