Кто-то уже открыл для этого билет в Connect .Ответ от Microsoft от 13.03.2012 состоял в том, что они еще не реализовали функцию в новых инструментах данных SQL Server, используемых Visual Studio 11, но планируют добавить ее в будущем.
Обходной путь - использовать сравнение данных VS 2010.