Мне непонятно, что вы подразумеваете под "использовать uniq только для столбца 1". Что вы хотите, чтобы столбец 1 появлялся несколько раз с разными значениями столбца 2? Если это может произойти, ваш вопрос, вероятно, нуждается в небольшом уточнении. Если этого не произойдет в вашем сценарии, то, вероятно, самое простое решение -
uniq -c filename