Не думаю, что вы можете использовать Source Control Explorer (полагаю, это связано с TFS?).
Но у вас есть несколько вариантов интеграции Subversion в Visual Studio:
В основном я использую TortoiseSVN (в качестве автономного клиента Subversion).
Я также установил AnkhSVN, потому что он позволяет мне видеть, какие файлы изменены в Visual Studio, но кроме этого мне действительно не нужно интегрированное решение Visual Studio для управления исходным кодом.