Ваша командная оболочка находится в том же каталоге, что и weka.jar?
Вы получаете это сообщение, если Java просто не может найти weka.jar
иди
dir weka.jar
и убедитесь, что командная оболочка может его найти.
Если нет, вам нужно перейти в папку, содержащую weka.jar
Или вы можете указать полный путь к weka.jar
$java -classpath /"your-weka-path"/weka.jar weka.classifiers.trees.J48 -t data/weather.arff -i