Возможно, в системе уже установлена Django.
Вы могли видеть, может ли это быть удалено (через apt-get?).
Во-вторых, предпочтительный метод установки пакетов Python - это virtualenv .
Это дает изолированную среду Python для вашего конкретного веб-сайта, где вы можете свободно устанавливать необходимые версии пакетов.