Я ничего не знаю о Spring Roo, так что, может быть, я говорю что-то очень глупое здесь ...
Этот menu.jspx компилируется в некоторый статический html? Если это так, вы можете указать Dojo проанализировать вашу начальную страницу, просто установив для parseOnLoad значение true в djConfig
var djConfig = {parseOnLoad: true, ...}
(в этом случае не требуется dojo.parser).
С другой стороны, если этот шаблон вставлен динамически, вам нужно будет вызвать dojo.parser.parse () корневого узла navMenu. Кажется, вы этого требуете, но я не понимаю, где это называется.