div с id = "container" имеет высоту 100%.Это означает 100% содержащего id = 'обертка' div.Одно из возможных решений - сделать высоту:
красная часть: 10% от общей высоты синий + желтый (т. Е. Div "wrapper"): 90% высоты
Это будет означать "«контейнер» должен приятно заполнить эти 90%.
Редактировать: единственным недостатком будет то, что красная часть больше не является фиксированной высотой по пикселям.