Это действительно зависит от того, что вы делаете, от того, что PHP будет быстрее, а от других MySQL.Если будет много операций чтения / записи из базы данных, я бы сказал, что MySQL быстрее, но если вы что-то делаете с массивами данных, PHP, скорее всего, будет быстрее.