Я использую File.applicationDirectory для нескольких приложений ipad и могу подтвердить, что все данные, записанные в эту папку, стираются при удалении приложения. Таким образом, возможность загрузить файл, ранее сохраненный в эту папку, дает вам то, что вы хотите.
var docDir:File = new File(File.applicationDirectory.nativePath + "/\.\./Documents"); //IOS specific
configFile = docDir.resolvePath("config.xml");
if (configFile.exists) {
var firstRun:Boolean = false;
configFile.addEventListener(Event.COMPLETE, onConfigLoaded);
configFile.load();
}else {
firstRun = true;
var configXML:XML = new XML("<?xml version='1.0' encoding='utf-8' ?><config />");
var fileStream:FileStream = new FileStream();
fileStream.open(configFile, FileMode.WRITE);
fileStream.writeUTFBytes(configXML);
fileStream.close();
}